Nature、Science、Cell系列上大尺度生物多样性研究精选33~260810-0816
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文献1
1.信息
标题：Fossil denticles reveal how ocean productivity shapes shark baselines and recovery potential 化石上的齿状结构揭示了海洋生产力如何决定鲨鱼的生存状况及恢复能力
DOI：https://doi.org/10.1126/science.aec2144
期刊：Science
2.摘要
珊瑚礁上的鲨鱼种群数量在全球范围内都有所减少，但由于缺乏关于人类活动之前自然变异情况的基准数据，因此很难进行准确的量化分析。通过研究保存在珊瑚礁沉积物中的鲨鱼皮肤鳞片化石，我们得以重建巴拿马地峡两岸在大规模捕捞开始之前（约 7000 至 3000 年前）以及最近时期（过去一个世纪）的鲨鱼群落状况。我们发现，巴拿马地峡两侧的鲨鱼种群数量及应对捕捞行为的能力存在差异。在人类活动之前，太平洋沿岸的珊瑚礁上鲨鱼的数量是加勒比海沿岸的 100 倍之多。自全新世中期以来，加勒比海地区的鲨鱼种群数量减少了 75%，而太平洋地区的鲨鱼种群则历经数千年仍然存活下来，尽管那里的捕捞压力更大。这些不同的发展轨迹与海洋生产力的差异密切相关，而海洋生产力又决定了各个地区的承载能力。因此，将海洋学背景纳入海洋保护的目标设定中显得非常重要。
3.图表
文献2
1.信息
标题：A functional-trophic pathway links riparian land use intensification to riverine community stability 一种功能性的营养途径表明，河岸地区的土地利用强度提升与河流生态系统的稳定性之间存在关联
DOI：https://doi.org/10.1126/sciadv.aeg0180
期刊：Science Advances
2.摘要
集约化的土地利用正在全球范围内改变河流生态系统，其中农业和城市化的土地利用变化最为显著。因此，了解这些普遍存在的压力如何影响生态系统的功能结构和营养结构，以及最终对生态系统稳定性的影响，是非常关键的。在这项研究中，我们通过在高分辨率的环境 DNA 监测基础上，对 213 个空间和时间上分层的采样点进行采样，并结合功能特征分析以及基于元网络的营养网络分析，来研究农业和城市土地利用变化对水生生态系统的影响。研究发现，鱼类、水生昆虫和藻类的功能特征组合具有明显的结构特征，并且随时间发生了显著的变化。此外，河岸地区的土地利用加剧与局部营养网络的功能多样性降低以及结构复杂性下降之间存在一致的关联。更高的模块性、嵌套性和稳定性，以及农业和城市地区的不适宜土地利用特征，都是维持生态系统稳定的关键因素。功能多样性和营养网络结构是社区稳定性的强有力预测因子。分段结构方程模型表明，增加土地利用强度会破坏多营养级生态系统的稳定性，其主要原因是抑制了生态系统的功能性和结构性特征，而非通过直接途径来实现这种破坏。总体而言，通过将这两种机制整合到一个统一的框架中，我们的研究为预测人类土地利用变化如何破坏生态系统稳定性提供了机制基础，并为在快速变化的环境中保护生物多样性提供了依据。
3.图表
文献3（Review）
1.信息
标题：Progress and future directions in dinosaur palaeontology 恐龙古生物学的进展和未来方向
DOI：https://doi.org/10.1038/s44358-026-00191-9
期刊：Nature Reviews Biodiversity
2.摘要
恐龙古生物学的起源可以追溯到大约200年前。自那时起，该领域已发展成为一门高度普及的跨学科科学。在本综述中，我们总结了目前对恐龙生物学、生态学、生物多样性和宏观演化的认识，重点关注可检验的科学实例。这些实例展示了如何运用定量方法分析来自恐龙化石及其相关地质和环境来源的分类学、形态学、生物地球化学和其他类型的数据，以及来自现生动物的比较数据。我们阐述了恐龙古生物学如何影响我们对现生生物的科学认知，以及现生生物反过来如何为古生物学研究提供信息。尽管恐龙古生物学面临着化石记录不完整的挑战，但结合不同证据来源和交叉检验策略的综合方法能够以数据为驱动，识别恐龙生态学和演化等诸多主题的模式和过程。包括人工智能辅助采集微观解剖和生物分子数据在内的新技术和分析工具，有望提升研究人员研究恐龙主导的陆地群落和生态系统的结构与功能，以及恐龙生物多样性与环境变化之间关联等主题的能力。归根结底，古生物学是一门以化石为基础的科学学科，因此在数据匮乏的地理区域和地质时期开展实地考察至关重要。
3.图表
文献4（Review）
1.信息
标题：Diversity, biogeography and assembly mechanisms of groundwater microbiomes 地下水微生物群落的多样性、生物地理学和组装机制
DOI：https://doi.org/10.1038/s43017-026-00813-y
期刊：Nature Reviews Earth & Environment
2.摘要
作为最大的可用淡水资源，地下水为全球数十亿人提供饮用水和农业灌溉用水。据估计，地下环境中栖息着地球上超过30%的微生物，微生物群落对各种地下水过程都起着重要作用。在地下水中发现的多种古菌、细菌、微型真核生物和病毒谱系，凸显了地下水微生物组在元素循环、污染物降解、致病性和抗菌素耐药性等方面的关键作用。本文综述了地下水中原核生物、微型真核生物和病毒群落的多样性和组成，并描述了这些不同微生物类群之间复杂的相互作用。地下水微生物组呈现出独特的生物地理格局，不同地下水类型和其他生境之间存在着显著的差异和相似之处。不同地下水环境中微生物群落的组成主要受随机过程驱动，而环境胁迫引起的确定性过程则进一步调节着群落的结构和功能。就其功能而言，地下水微生物群在塑造生态系统功能方面发挥着至关重要的作用，包括生物地球化学循环、水质和“同一健康”理念。最后，我们重点介绍了未来利用微生物群作为生态可持续解决方案，在不断变化的世界中进行地下水修复和保护的若干研究前景。
3.图表
文献5（Comment）
1.信息
标题：Soil microbial conservation cannot rely on above-ground biodiversity 土壤微生物保护不能依赖于地上生物多样性
DOI：https://doi.org/10.1038/s43017-026-00813-y
期刊：Nature Reviews Microbiology
2.摘要
土壤生物多样性是生态系统功能和植物健康的基础，然而，地下微生物的惊人多样性在保护工作中却常常被忽视。本文概述了土壤微生物保护面临的四大挑战，并强调了应对这些挑战对于保护土壤生物多样性的重要性。
3.图表
说明
以上文献顺序随机排列，仅为个人挑选结果，无严格标准，十分主观，仅供参考。
整理结果中，图表因篇幅限制只放了一张；挑选的文章中有时会有部分不是严格意义上的研究型或综述型Article，但是觉得比较有趣，也一并整理。
以宏观为主。有些研究是微观研究升尺度，或者仅与生物多样性略微相关，也挑选了一部分。
挑选期刊的主要范围：
Nature系列：Nature，Nature Reviews Earth & Environment，Nature Reviews Biodiversity，Nature Climate Change，Nature Water，Nature Sustainability，Nature Food，Nature Ecology & Evolution，Nature Geoscience，Nature Plants，Nature Cities，Nature Communications
Science系列：Science，Science Advances
Cell系列：Trends in Ecology & Evolution，One Earth
（Nature Communications和Science Advances有时会单独整理一份）